复旦团队绘制全球最大腔面型乳腺癌多组学全景图谱

2024-09-12
来源:网络整理

乳腺癌已成为中国女性最常见的恶性肿瘤,发病率呈快速上升趋势。

目前乳腺癌在临床上主要分为空洞型乳腺癌、HER2阳性乳腺癌、三阴性乳腺癌,其中空洞型乳腺癌占比最高,约70%,该类患者虽然早期治疗后愈合良好,但术后10年甚至30年甚至更长时间也可能面临复发。

这类患者如何才能得到更有效的治疗?

复旦大学附属肿瘤医院邵志敏教授、蒋逸舟研究员团队,联合复旦大学生命科学学院、人类表型研究所、上海生物医学技术研究院等科研人员,历时五年研究绘制出全球最大的空洞型乳腺癌多组学全景图谱,并提出基于“复旦空洞型四型”的精准治疗策略。该项重要成果近日发表于国际顶级期刊《自然遗传学》( ,影响因子30.8)。该论文的共同第一作者为金曦、周一凡、、赵申、林思锦,通讯作者为邵志敏、蒋逸舟。

在乳腺癌的三大类型中,空洞型乳腺癌占比最高,约70%。本文除署名外,所有图片均由澎湃新闻记者陈思思拍摄。

空洞型乳腺癌有四种亚型,可根据其分类进行治疗。

邵志敏介绍,临床上,近70%的初诊患者和半数以上的复发、转移患者为空洞型乳腺癌患者。该类患者有三大特点:第一,患者基数大;第二,治疗方法多,内分泌治疗效果显著;第三,内部异质性强,不同患者疗效差异较大。

“内分泌治疗是面部乳腺癌的主要治疗方法之一,但我们经常看到临床表现非常相似的患者,有的患者通过服用同一种内分泌药物就能长期控制病情,有的患者则会在不同时间点出现内分泌耐药和复发转移,这说明面部乳腺癌其实是一个非常异质性的群体。”邵志敏说,“如果只是简单地增加或减少治疗的强度和时间,并不能给这些患者带来太大的获益,而应该将这些患者分类得更细,给予个性化的治疗方案。”

邵志敏(左一)及其研究团队部分成员。照片由受访者提供

基于上述原因,邵志敏、蒋逸舟带领的研究团队,与复旦大学生命科学学院及人类表型研究所石乐明教授、郑元廷教授团队,以及上海生物医学技术研究所黄伟教授团队联合组成研究联盟。

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研究团队通过对基因组学、转录组学、代谢组学和蛋白质组学的深入分析,证实面部空洞性乳腺癌确实并非传统认识的单一类型。面部空洞性乳腺癌不仅有自己的“家族”,而且该家族中还有不同的亚型,不同亚型的分子特征差异很大,对不同治疗方案的敏感性也有很大差异。

研究团队结合生物信息大数据特点,将空洞型乳腺癌精准划分为经典空洞型(SNF1)、免疫调节型(SNF2)、增殖型(SNF3)和RTK驱动型(SNF4)四种亚型,占比分别为24.5%、25.4%、33.6%和16.5%。

“我们发现在四种空洞型乳腺癌亚型中,‘RTK驱动’患者的预后最差,内分泌治疗几乎无效。这表明我们需要进一步探究其潜在机制,加快该亚型的药物研发和治疗方案创新。”邵志敏强调。

对于如何进行“分类”,蒋一舟介绍,通过医院一站式人工智能精准诊疗系统,结合数字病理和AI技术,目前医院可以将精准诊断时间从传统的几十天缩短到1个小时以内。同时,这套系统未来还可以推广应用到多个临床中心,惠及更多患者。

最新方案全面启动,多项精准医疗临床试验启动

邵志敏团队根据面部空洞型乳腺癌各亚型的特点,提出了“基于面部空洞型乳腺癌分子分型的精准治疗策略”。

研究团队发现,“免疫调节”亚型中免疫细胞丰富,提示该类肿瘤可以使用免疫检查点抑制剂治疗;“增殖”亚型细胞周期通路高表达、DNA损伤修复存在缺陷,提示该类患者可以使用CDK4/6抑制剂和PARP抑制剂治疗;而“RTK驱动”亚型以RTK及其通路显著表达为特点,提示该类患者可以考虑使用RTK通路抑制剂治疗。

针对面部空洞型乳腺癌分类的精准治疗策略。

研究团队随后收集并整理了复旦大学附属肿瘤医院及国内多家医院数千例乳腺癌空洞症病例的真实世界使用和疗效数据,证实了乳腺癌空洞症“复旦分类”能很好地预测不同药物的治疗效果。团队还前瞻性收集了不同分类的乳腺癌空洞症患者来源的类器官模型(PDO),并进行了大规模的药敏试验,进一步证实了“精准分类”策略的有效性。

基于以上研究成果,邵志敏带领复旦大学附属肿瘤医院乳腺癌多学科团队开展了多项针对空洞型乳腺癌精准治疗的临床试验,以进一步验证“精准分类”策略,让研究成果尽快服务于患者。

例如,针对早期、局部晚期患者,研究团队在面部空洞型乳腺癌“复旦分型”的指导下,设计了精准新辅助治疗的平台型临床研究(-N),旨在探索精准治疗下肿瘤最快速度缩小的方法,为不适合手术的患者提供手术机会;针对晚期面部空洞型乳腺癌患者,团队设计了多个针对不同亚型的临床试验,如针对“免疫调节型(SNF2)”的临床试验,旨在为晚期患者提供更合适、更精准的治疗方案。

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