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支付宝是第三方支付机构，不同于商业银行等正规金融机构。主要提供货币转移支付服务。因此，本质上，支付宝是一个与银行服务互补的支付机构。

与商业银行相比，支付宝中存储的资金安全性较差。商业银行受到国家明确的存款保险制度的保护，一旦发生倒闭，可享受最高50万元的存款保险赔偿。支付宝作为第三方支付机构，并没有类似的保险系统支持。但由于其作为互联网金融企业资金量较大，能够覆盖大部分风险情况，因此单纯将资金存入支付宝余额的风险也比较小。

接下来我们讨论余额宝。余额宝是天弘基金旗下子公司，通过购买天弘基金旗下货币市场基金实现投资增值。货币市场基金作为基金产品，其风险高于银行存款，但低于其他资本市场投资产品。因此，使用余额宝虽然存在一定的风险，但总体风险并不大。

另外值得一提的是，蚂蚁金服的母公司还拥有一家银行——网商银行。如果您对支付宝存入资金仍不放心，可以选择存入网商银行，同样享受存款保险制度的保障。只要资金不超过50万元，就相对安全。

综上所述，支付宝作为第三方支付机构，与商业银行存在一定的安全差异。但只要合理使用和管理，将资金存入支付宝或余额宝并没有风险。同时，您也可以考虑选择蚂蚁金服旗下的网商银行，作为更安全可靠的储蓄方式。